发布者:IVD资讯
发布时间:2024-07-05
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随着生物医学的发展,DNA甲基化(DNA methylation)标志物在癌症诊断、治疗选择及预后评估中的重要性日益凸显。在现代肿瘤治疗领域,肿瘤 DNA 甲基化标志物作为一种重要的生物标志物,在癌症的早期诊断、治疗选择及预后评估中扮演着越来越关键的角色。
图1.正常细胞与肿瘤细胞DNA甲基化的状态
DNA 甲基化是一种 DNA 的共价修饰,具体是指DNA 甲基转移酶(DNA methyltransferases,DNMTs)将甲基加到 DNA CpG 序列中胞嘧啶的 5'碳位,形成 5⁃甲基胞嘧啶的过程。成簇的 CpG被称为 CpG岛(CpG islands,CGIs),主要位于结构基因的启动子和第一外显子区域。DNA 甲基化标志物是癌细胞中的 DNA异常甲基化改变,这种异常甲基化贯穿于癌症发生和发展的全过程。
肿瘤DNA甲基化标志物检测及临床应用专家共识(2024版)指出:与传统的肿瘤标志物相比,DNA甲基化标志物具有更早期、更无创、更精准等优点。因此,可以通过非侵入性方式获得的痰液、血浆、血清或尿液等样本进行 DNA 甲基化标志物检测。一些DNA甲基化异常发生在肿瘤形成的初始阶段,通过检测与肿瘤发展相关的甲基化标志物,可以辅助癌症早期诊断、评估进展风险。DNA 甲基化标志物甲基化水平的增加或降低与肿瘤预后密切相关,可用于治疗或根治性手术后评估肿瘤微小残留病灶(MRD)和监测复发。此外,DNA甲基化标志物还可作为化疗敏感性的标志,某些特定基因的甲基化可能预示着癌症对治疗的反应,可用于判断化疗药物的疗效,以更好地指导治疗方案。
DNA甲基化标志物检测技术方法
图2.DNA甲基化标志物检测技术方法
甲基化建库试剂盒搭配MGI测序接头一直以来为技术难点,MGI 测序接头与 Illumina Y 字型接头类型存在很大的差异,MGI 测序接头 Linear adapter 与 Bubble adapter 长度不同但两端互补配对,因此会产生小泡状结构,小泡状结构会降低与单链DNA的连接效率,影响文库产出和检测的灵敏度。
翌圣生物甲基化研发团队基于创新的MGI接头设计方式和优化接头连接体系,开发出DNA甲基化MGI平台文库构建试剂盒,性能媲美于Illumina平台文库构建试剂盒,拥有优异的接头连接效率,较高的文库产出,满足微量cfDNA样本的甲基化建库需求。
Hieff NGS® Methyl-seq DNA library Prep kit for MGI(Cat#12226ES)
产品简介
Hieff NGS® Methyl-seq DNA Library Prep Kit for MGI 是针对 MGI 测序平台专业开发设计的新一代 DNA 甲基化建库试剂盒,可以满足甲基化转化后10 pg~250 ng DNA 样本建库。该试剂盒可兼容短至 40 bp 的 DNA 样本,适应于先转化后建库。
产品亮点
投入量低:可满足10 pg~250 ng起始量的样本建库
数据质量佳:不同样本类型及不同投入量条件下均表现出优异的数据质量
操作简便:2小时左右可以完成建库
产品性能
MGI平台甲基化建库试剂12226和Illumina平台甲基化建库试剂12221的性能相当,MGI平台甲基化建库试剂12226的dup率更低。
图3.不同样本投入量下的文库产量和下机数据基本指标
2、亚硫酸氢盐转化和酶法转化后,采用12226建库,不同样本投入量下的文库产量和下机数据基本指标
相同的样本投入量,酶法转化搭配MGI平台甲基化建库试剂12226的文库浓度和数据质量更高,插入片段更长,文库丰富度更高。
图4.亚硫酸氢盐转化和酶法转化后的文库产量和下机数据基本指标
新品预告
敲重点:申请DNA 甲基化建库MGI试剂盒试用装,请联系当地销售或技术,数量有限,试用回馈数据有奖。
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