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IVD知名分子企业,DNA甲基化建库技术突破!

发布者:IVD资讯

发布时间:2024-07-05

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随着生物医学的发展,DNA甲基化(DNA methylation)标志物在癌症诊断、治疗选择及预后评估中的重要性日益凸显。在现代肿瘤治疗领域,肿瘤 DNA 甲基化标志物作为一种重要的生物标志物,在癌症的早期诊断、治疗选择及预后评估中扮演着越来越关键的角色。


图1.正常细胞与肿瘤细胞DNA甲基化的状态


DNA 甲基化是一种 DNA 的共价修饰,具体是指DNA 甲基转移酶(DNA methyltransferases,DNMTs)将甲基加到 DNA CpG 序列中胞嘧啶的 5'碳位,形成 5⁃甲基胞嘧啶的过程。成簇的 CpG被称为 CpG岛(CpG islands,CGIs),主要位于结构基因的启动子和第一外显子区域。DNA 甲基化标志物是癌细胞中的 DNA异常甲基化改变,这种异常甲基化贯穿于癌症发生和发展的全过程。


肿瘤DNA甲基化标志物检测及临床应用专家共识(2024版)指出:与传统的肿瘤标志物相比,DNA甲基化标志物具有更早期、更无创、更精准等优点。因此,可以通过非侵入性方式获得的痰液、血浆、血清或尿液等样本进行 DNA 甲基化标志物检测。一些DNA甲基化异常发生在肿瘤形成的初始阶段,通过检测与肿瘤发展相关的甲基化标志物,可以辅助癌症早期诊断、评估进展风险。DNA 甲基化标志物甲基化水平的增加或降低与肿瘤预后密切相关,可用于治疗或根治性手术后评估肿瘤微小残留病灶(MRD)和监测复发。此外,DNA甲基化标志物还可作为化疗敏感性的标志,某些特定基因的甲基化可能预示着癌症对治疗的反应,可用于判断化疗药物的疗效,以更好地指导治疗方案



DNA甲基化标志物检测技术方法

图2.DNA甲基化标志物检测技术方法


甲基化建库试剂盒搭配MGI测序接头一直以来为技术难点,MGI 测序接头与 Illumina Y 字型接头类型存在很大的差异,MGI 测序接头 Linear adapter 与 Bubble adapter 长度不同但两端互补配对,因此会产生小泡状结构,小泡状结构会降低与单链DNA的连接效率,影响文库产出和检测的灵敏度。


翌圣生物甲基化研发团队基于创新的MGI接头设计方式和优化接头连接体系,开发出DNA甲基化MGI平台文库构建试剂盒,性能媲美于Illumina平台文库构建试剂盒,拥有优异的接头连接效率,较高的文库产出,满足微量cfDNA样本的甲基化建库需求。





Hieff NGS® Methyl-seq DNA library Prep kit for MGI(Cat#12226ES)




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产品简介


Hieff NGS® Methyl-seq DNA Library Prep Kit for MGI 是针对 MGI 测序平台专业开发设计的新一代 DNA 甲基化建库试剂盒,可以满足甲基化转化后10 pg~250 ng DNA 样本建库。该试剂盒可兼容短至 40 bp 的 DNA 样本,适应于先转化后建库。


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产品亮点


  • 投入量低:可满足10 pg~250 ng起始量的样本建库

  • 数据质量佳:不同样本类型及不同投入量条件下均表现出优异的数据质量

  • 操作简便:2小时左右可以完成建库


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产品性能



1、亚硫酸氢盐转化后,采用12221和12226建库,不同样本投入量下的文库产量和下机数据基本指标

MGI平台甲基化建库试剂12226和Illumina平台甲基化建库试剂12221的性能相当,MGI平台甲基化建库试剂12226的dup率更低。


图3.不同样本投入量下的文库产量和下机数据基本指标



2、亚硫酸氢盐转化和酶法转化后,采用12226建库,不同样本投入量下的文库产量和下机数据基本指标

相同的样本投入量,酶法转化搭配MGI平台甲基化建库试剂12226的文库浓度和数据质量更高,插入片段更长,文库丰富度更高。


图4.亚硫酸氢盐转化和酶法转化后的文库产量和下机数据基本指标



新品预告

敲重点:申请DNA 甲基化建库MGI试剂盒试用装,请联系当地销售或技术,数量有限,试用回馈数据有奖。



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翌圣生物

翌圣生物科技(上海)股份有限公司是一家聚焦生命科学产业链上游核心原料,从事分子、蛋白和细胞三大品类生物试剂的研发、生产与销售的高新技术企业。核心产品覆盖qPCR系列、NGS系列、逆转录系列、核酸提取与纯化系列、PCR系列、分子克隆系列、体外转录系列、抗体、蛋白纯化系列、蛋白分析系列、重组蛋白、细胞分析系列、细胞培养系列、细胞转染系列、报告基因检测系列等多个品类,广泛应用于生命科学研究、诊断检测和生物医药等领域。

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