《SLCO1B1和ApoE基因多态性检测与他汀类药物临床应用专家共识》指出，ApoE 基因型编码的各ApoE异构体与脂蛋白受体的亲和力及其在体内的代谢速度不同，最终影响个体间的血脂水平。ApoE E2对LDL-R亲和力下降，使用他汀类药物治疗时血TC和 LDL-C降幅更大，降脂疗效较佳；而ApoE E4与LDL-R亲和力最高，ApoE E4 携带者血脂水平更高，服用他汀类药物往往疗效不佳或无效。因此，首次服用他汀类药物，为评估他汀类药物治疗效果，建议在用药前检测 ApoE基因多态性；启用他汀类药物治疗后，若降脂疗效不佳，建议检测ApoE基因多态性分析原因。

基因型ε3/ε4、ε4/ε4携带者体内胆固醇及低密度脂蛋白水平较高，而基因型ε2/ε2、ε2/ε3携带者体内胆固醇及低密度脂蛋白水平较低，体内高密度脂蛋白水平较高。

《中国痴呆与认知障碍诊治指南：阿尔茨海默病的危险因素及其干预》指出，不同ApoE等位基因对AD发病风险的影响各不相同，其中ApoE ε4等位基因携带者AD的患病风险增加，平均发病年龄降低。携带一个ApoE ε4等位基因人群，其罹患AD的风险约是正常人的3.2倍，而携带两个ApoE ε4等位基因人群，其罹患AD的风险是正常人的8-12倍，确诊阿尔兹海默症的人群，约58%的患者携带至少1个APOE E4等位基因。

ApoE ε4与ApoE ε3相比，显著增加脑梗塞的发生风险。ApoE ε2与ApoE ε3相比，没有增加脑梗塞的发生风险。ApoE ε2对动脉斑块的生成具有保护性作用，并且有显著降低低密度脂蛋白LDL-C水平的作用。